Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2E1P51965 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2E1P51965 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBE2E1P51965 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBE2E1P51965 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
UBE2E1P51965 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
UBE2E1P51965 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
UBE2E1P51965 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE2E1P51965 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE2E1P51965 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE2E1P51965 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE2E1P51965 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE2E1P51965 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
UBE2E1P51965 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UBE2E1P51965 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UBE2E1P51965 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBE2E1P51965 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UBE2E1P51965 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UBE2E1P51965 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
UBE2E1P51965 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBE2E1P51965 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBE2E1P51965 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
UBE2E1P51965 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBE2E1P51965 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBE2E1P51965 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UBE2E1P51965 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UBE2E1P51965 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBE2E1P51965 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE2E1P51965 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE2E1P51965 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBE2E1P51965 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE2E1P51965 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE2E1P51965 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE2E1P51965 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE2E1P51965 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE2E1P51965 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBE2E1P51965 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE2E1P51965 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE2E1P51965 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE2E1P51965 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE2E1P51965 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE2E1P51965 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UBE2E1P51965 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms