Protein–RNA interactions for Protein: P51168

SCNN1B, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1BP51168 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCNN1BP51168 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCNN1BP51168 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCNN1BP51168 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SCNN1BP51168 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCNN1BP51168 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCNN1BP51168 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCNN1BP51168 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCNN1BP51168 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCNN1BP51168 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SCNN1BP51168 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCNN1BP51168 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCNN1BP51168 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCNN1BP51168 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCNN1BP51168 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCNN1BP51168 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SCNN1BP51168 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SCNN1BP51168 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCNN1BP51168 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SCNN1BP51168 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCNN1BP51168 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCNN1BP51168 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCNN1BP51168 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCNN1BP51168 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCNN1BP51168 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCNN1BP51168 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SCNN1BP51168 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCNN1BP51168 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCNN1BP51168 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SCNN1BP51168 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SCNN1BP51168 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCNN1BP51168 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SCNN1BP51168 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCNN1BP51168 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCNN1BP51168 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCNN1BP51168 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCNN1BP51168 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCNN1BP51168 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms