Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSEN1P49768 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSEN1P49768 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSEN1P49768 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSEN1P49768 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSEN1P49768 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PSEN1P49768 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSEN1P49768 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSEN1P49768 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSEN1P49768 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSEN1P49768 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSEN1P49768 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSEN1P49768 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSEN1P49768 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSEN1P49768 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSEN1P49768 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSEN1P49768 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSEN1P49768 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSEN1P49768 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PSEN1P49768 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSEN1P49768 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PSEN1P49768 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSEN1P49768 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSEN1P49768 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSEN1P49768 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSEN1P49768 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSEN1P49768 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSEN1P49768 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PSEN1P49768 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSEN1P49768 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSEN1P49768 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PSEN1P49768 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSEN1P49768 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSEN1P49768 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSEN1P49768 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSEN1P49768 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSEN1P49768 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PSEN1P49768 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSEN1P49768 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSEN1P49768 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSEN1P49768 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSEN1P49768 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSEN1P49768 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSEN1P49768 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSEN1P49768 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSEN1P49768 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSEN1P49768 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PSEN1P49768 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSEN1P49768 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSEN1P49768 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PSEN1P49768 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PSEN1P49768 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSEN1P49768 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSEN1P49768 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSEN1P49768 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSEN1P49768 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSEN1P49768 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSEN1P49768 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSEN1P49768 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSEN1P49768 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PSEN1P49768 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSEN1P49768 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSEN1P49768 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSEN1P49768 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PSEN1P49768 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PSEN1P49768 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PSEN1P49768 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSEN1P49768 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PSEN1P49768 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSEN1P49768 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSEN1P49768 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSEN1P49768 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSEN1P49768 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSEN1P49768 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSEN1P49768 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSEN1P49768 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSEN1P49768 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSEN1P49768 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSEN1P49768 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSEN1P49768 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSEN1P49768 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSEN1P49768 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSEN1P49768 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSEN1P49768 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSEN1P49768 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSEN1P49768 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSEN1P49768 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSEN1P49768 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSEN1P49768 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSEN1P49768 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSEN1P49768 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSEN1P49768 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSEN1P49768 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSEN1P49768 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSEN1P49768 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSEN1P49768 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSEN1P49768 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSEN1P49768 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PSEN1P49768 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PSEN1P49768 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms