Protein–RNA interactions for Protein: P49748

ACADVL, Very long-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADVLP49748 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACADVLP49748 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACADVLP49748 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACADVLP49748 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACADVLP49748 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACADVLP49748 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACADVLP49748 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACADVLP49748 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACADVLP49748 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACADVLP49748 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ACADVLP49748 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACADVLP49748 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ACADVLP49748 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACADVLP49748 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACADVLP49748 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACADVLP49748 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACADVLP49748 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACADVLP49748 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACADVLP49748 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACADVLP49748 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACADVLP49748 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACADVLP49748 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ACADVLP49748 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACADVLP49748 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACADVLP49748 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACADVLP49748 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACADVLP49748 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACADVLP49748 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACADVLP49748 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACADVLP49748 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACADVLP49748 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACADVLP49748 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACADVLP49748 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACADVLP49748 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACADVLP49748 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACADVLP49748 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACADVLP49748 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACADVLP49748 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACADVLP49748 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACADVLP49748 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACADVLP49748 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACADVLP49748 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ACADVLP49748 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ACADVLP49748 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACADVLP49748 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACADVLP49748 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACADVLP49748 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACADVLP49748 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACADVLP49748 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ACADVLP49748 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACADVLP49748 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACADVLP49748 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACADVLP49748 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACADVLP49748 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACADVLP49748 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACADVLP49748 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACADVLP49748 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACADVLP49748 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACADVLP49748 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACADVLP49748 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACADVLP49748 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ACADVLP49748 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACADVLP49748 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACADVLP49748 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACADVLP49748 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACADVLP49748 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACADVLP49748 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACADVLP49748 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACADVLP49748 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACADVLP49748 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACADVLP49748 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACADVLP49748 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACADVLP49748 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACADVLP49748 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACADVLP49748 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACADVLP49748 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACADVLP49748 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ACADVLP49748 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACADVLP49748 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ACADVLP49748 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACADVLP49748 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACADVLP49748 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACADVLP49748 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACADVLP49748 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACADVLP49748 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACADVLP49748 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACADVLP49748 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACADVLP49748 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACADVLP49748 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACADVLP49748 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACADVLP49748 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACADVLP49748 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACADVLP49748 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACADVLP49748 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACADVLP49748 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACADVLP49748 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACADVLP49748 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ACADVLP49748 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACADVLP49748 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACADVLP49748 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms