Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CSNK1EP49674 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSNK1EP49674 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSNK1EP49674 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSNK1EP49674 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSNK1EP49674 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSNK1EP49674 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSNK1EP49674 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSNK1EP49674 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSNK1EP49674 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSNK1EP49674 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSNK1EP49674 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSNK1EP49674 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSNK1EP49674 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSNK1EP49674 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSNK1EP49674 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSNK1EP49674 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSNK1EP49674 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSNK1EP49674 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CSNK1EP49674 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSNK1EP49674 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSNK1EP49674 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CSNK1EP49674 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSNK1EP49674 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSNK1EP49674 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSNK1EP49674 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CSNK1EP49674 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSNK1EP49674 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSNK1EP49674 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSNK1EP49674 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSNK1EP49674 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSNK1EP49674 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSNK1EP49674 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CSNK1EP49674 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSNK1EP49674 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSNK1EP49674 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSNK1EP49674 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSNK1EP49674 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSNK1EP49674 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSNK1EP49674 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CSNK1EP49674 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSNK1EP49674 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSNK1EP49674 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSNK1EP49674 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CSNK1EP49674 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSNK1EP49674 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSNK1EP49674 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSNK1EP49674 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSNK1EP49674 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSNK1EP49674 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CSNK1EP49674 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSNK1EP49674 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CSNK1EP49674 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSNK1EP49674 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSNK1EP49674 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSNK1EP49674 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSNK1EP49674 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSNK1EP49674 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSNK1EP49674 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSNK1EP49674 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSNK1EP49674 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSNK1EP49674 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CSNK1EP49674 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSNK1EP49674 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSNK1EP49674 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CSNK1EP49674 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSNK1EP49674 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSNK1EP49674 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSNK1EP49674 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSNK1EP49674 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSNK1EP49674 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSNK1EP49674 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSNK1EP49674 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSNK1EP49674 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSNK1EP49674 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSNK1EP49674 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSNK1EP49674 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSNK1EP49674 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSNK1EP49674 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSNK1EP49674 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSNK1EP49674 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSNK1EP49674 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSNK1EP49674 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CSNK1EP49674 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSNK1EP49674 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CSNK1EP49674 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSNK1EP49674 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSNK1EP49674 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSNK1EP49674 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSNK1EP49674 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSNK1EP49674 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CSNK1EP49674 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSNK1EP49674 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CSNK1EP49674 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSNK1EP49674 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSNK1EP49674 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSNK1EP49674 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSNK1EP49674 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSNK1EP49674 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSNK1EP49674 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms