Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TGM4P49221 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TGM4P49221 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TGM4P49221 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TGM4P49221 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TGM4P49221 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TGM4P49221 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TGM4P49221 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TGM4P49221 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TGM4P49221 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TGM4P49221 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TGM4P49221 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TGM4P49221 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TGM4P49221 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TGM4P49221 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TGM4P49221 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TGM4P49221 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TGM4P49221 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TGM4P49221 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TGM4P49221 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TGM4P49221 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TGM4P49221 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TGM4P49221 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TGM4P49221 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TGM4P49221 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TGM4P49221 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TGM4P49221 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TGM4P49221 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TGM4P49221 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TGM4P49221 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TGM4P49221 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TGM4P49221 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TGM4P49221 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TGM4P49221 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TGM4P49221 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TGM4P49221 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TGM4P49221 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TGM4P49221 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TGM4P49221 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TGM4P49221 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TGM4P49221 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TGM4P49221 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TGM4P49221 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TGM4P49221 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TGM4P49221 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TGM4P49221 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TGM4P49221 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TGM4P49221 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TGM4P49221 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TGM4P49221 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TGM4P49221 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TGM4P49221 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TGM4P49221 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TGM4P49221 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TGM4P49221 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TGM4P49221 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TGM4P49221 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TGM4P49221 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TGM4P49221 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TGM4P49221 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TGM4P49221 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TGM4P49221 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TGM4P49221 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TGM4P49221 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TGM4P49221 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TGM4P49221 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TGM4P49221 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TGM4P49221 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TGM4P49221 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TGM4P49221 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TGM4P49221 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TGM4P49221 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TGM4P49221 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TGM4P49221 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TGM4P49221 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TGM4P49221 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TGM4P49221 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TGM4P49221 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TGM4P49221 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TGM4P49221 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TGM4P49221 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TGM4P49221 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TGM4P49221 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TGM4P49221 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TGM4P49221 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TGM4P49221 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TGM4P49221 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TGM4P49221 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TGM4P49221 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TGM4P49221 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TGM4P49221 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TGM4P49221 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TGM4P49221 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TGM4P49221 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TGM4P49221 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TGM4P49221 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TGM4P49221 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TGM4P49221 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TGM4P49221 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TGM4P49221 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms