Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPC1P48995 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPC1P48995 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPC1P48995 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRPC1P48995 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRPC1P48995 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRPC1P48995 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRPC1P48995 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRPC1P48995 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRPC1P48995 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRPC1P48995 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRPC1P48995 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRPC1P48995 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRPC1P48995 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRPC1P48995 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRPC1P48995 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRPC1P48995 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRPC1P48995 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRPC1P48995 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRPC1P48995 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRPC1P48995 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRPC1P48995 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRPC1P48995 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRPC1P48995 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRPC1P48995 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRPC1P48995 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRPC1P48995 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRPC1P48995 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRPC1P48995 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRPC1P48995 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRPC1P48995 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRPC1P48995 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRPC1P48995 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms