Protein–RNA interactions for Protein: P48728

AMT, Aminomethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMTP48728 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AMTP48728 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AMTP48728 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AMTP48728 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMTP48728 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMTP48728 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMTP48728 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMTP48728 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMTP48728 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMTP48728 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMTP48728 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMTP48728 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMTP48728 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMTP48728 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMTP48728 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMTP48728 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMTP48728 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMTP48728 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMTP48728 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
AMTP48728 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMTP48728 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMTP48728 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
AMTP48728 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMTP48728 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
AMTP48728 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMTP48728 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMTP48728 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMTP48728 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMTP48728 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMTP48728 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMTP48728 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMTP48728 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
AMTP48728 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AMTP48728 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AMTP48728 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AMTP48728 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AMTP48728 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AMTP48728 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AMTP48728 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AMTP48728 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AMTP48728 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
AMTP48728 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AMTP48728 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AMTP48728 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AMTP48728 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AMTP48728 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
AMTP48728 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
AMTP48728 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AMTP48728 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AMTP48728 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AMTP48728 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AMTP48728 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AMTP48728 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AMTP48728 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AMTP48728 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
AMTP48728 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AMTP48728 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
AMTP48728 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AMTP48728 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AMTP48728 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AMTP48728 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AMTP48728 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AMTP48728 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AMTP48728 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AMTP48728 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AMTP48728 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AMTP48728 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AMTP48728 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
AMTP48728 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
AMTP48728 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AMTP48728 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
AMTP48728 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
AMTP48728 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
AMTP48728 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
AMTP48728 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
AMTP48728 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
AMTP48728 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMTP48728 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMTP48728 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMTP48728 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMTP48728 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
AMTP48728 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMTP48728 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMTP48728 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
AMTP48728 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMTP48728 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMTP48728 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMTP48728 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMTP48728 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMTP48728 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMTP48728 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMTP48728 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMTP48728 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMTP48728 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMTP48728 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
AMTP48728 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMTP48728 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMTP48728 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMTP48728 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
AMTP48728 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms