Protein–RNA interactions for Protein: P48449

LSS, Lanosterol synthase, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSSP48449 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LSSP48449 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LSSP48449 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LSSP48449 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LSSP48449 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LSSP48449 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSSP48449 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSSP48449 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSSP48449 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSSP48449 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LSSP48449 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSSP48449 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LSSP48449 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSSP48449 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSSP48449 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSSP48449 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LSSP48449 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSSP48449 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSSP48449 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSSP48449 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSSP48449 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSSP48449 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LSSP48449 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSSP48449 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSSP48449 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LSSP48449 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSSP48449 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSSP48449 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSSP48449 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSSP48449 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSSP48449 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSSP48449 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSSP48449 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LSSP48449 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSSP48449 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSSP48449 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSSP48449 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSSP48449 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSSP48449 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LSSP48449 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LSSP48449 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LSSP48449 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LSSP48449 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LSSP48449 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LSSP48449 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LSSP48449 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LSSP48449 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSSP48449 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSSP48449 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSSP48449 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSSP48449 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LSSP48449 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSSP48449 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSSP48449 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSSP48449 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LSSP48449 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LSSP48449 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSSP48449 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSSP48449 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSSP48449 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSSP48449 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LSSP48449 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSSP48449 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSSP48449 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSSP48449 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSSP48449 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSSP48449 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSSP48449 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSSP48449 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSSP48449 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSSP48449 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSSP48449 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSSP48449 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSSP48449 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSSP48449 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSSP48449 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSSP48449 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSSP48449 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSSP48449 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSSP48449 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LSSP48449 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSSP48449 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LSSP48449 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSSP48449 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSSP48449 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSSP48449 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LSSP48449 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LSSP48449 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSSP48449 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LSSP48449 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LSSP48449 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSSP48449 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSSP48449 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSSP48449 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSSP48449 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LSSP48449 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LSSP48449 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LSSP48449 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LSSP48449 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSSP48449 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms