Protein–RNA interactions for Protein: P48380

RFX3, Transcription factor RFX3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3P48380 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFX3P48380 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFX3P48380 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFX3P48380 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFX3P48380 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFX3P48380 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFX3P48380 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFX3P48380 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFX3P48380 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFX3P48380 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFX3P48380 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFX3P48380 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFX3P48380 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFX3P48380 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RFX3P48380 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RFX3P48380 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFX3P48380 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFX3P48380 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFX3P48380 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFX3P48380 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RFX3P48380 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFX3P48380 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFX3P48380 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFX3P48380 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFX3P48380 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFX3P48380 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFX3P48380 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFX3P48380 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RFX3P48380 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RFX3P48380 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RFX3P48380 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFX3P48380 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFX3P48380 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFX3P48380 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RFX3P48380 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFX3P48380 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFX3P48380 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFX3P48380 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFX3P48380 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFX3P48380 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFX3P48380 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFX3P48380 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RFX3P48380 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFX3P48380 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFX3P48380 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RFX3P48380 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFX3P48380 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RFX3P48380 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RFX3P48380 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFX3P48380 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFX3P48380 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFX3P48380 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RFX3P48380 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFX3P48380 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RFX3P48380 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFX3P48380 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFX3P48380 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFX3P48380 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFX3P48380 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFX3P48380 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RFX3P48380 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RFX3P48380 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RFX3P48380 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RFX3P48380 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RFX3P48380 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RFX3P48380 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RFX3P48380 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RFX3P48380 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RFX3P48380 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RFX3P48380 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFX3P48380 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFX3P48380 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFX3P48380 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFX3P48380 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFX3P48380 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RFX3P48380 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RFX3P48380 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RFX3P48380 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RFX3P48380 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RFX3P48380 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RFX3P48380 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFX3P48380 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFX3P48380 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFX3P48380 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFX3P48380 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFX3P48380 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFX3P48380 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFX3P48380 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RFX3P48380 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFX3P48380 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFX3P48380 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFX3P48380 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFX3P48380 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFX3P48380 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFX3P48380 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFX3P48380 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RFX3P48380 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFX3P48380 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFX3P48380 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RFX3P48380 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms