Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ME1P48163 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ME1P48163 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ME1P48163 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ME1P48163 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ME1P48163 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ME1P48163 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ME1P48163 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ME1P48163 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ME1P48163 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ME1P48163 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ME1P48163 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ME1P48163 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ME1P48163 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ME1P48163 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ME1P48163 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ME1P48163 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ME1P48163 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ME1P48163 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ME1P48163 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ME1P48163 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ME1P48163 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ME1P48163 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ME1P48163 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ME1P48163 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ME1P48163 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ME1P48163 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ME1P48163 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ME1P48163 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ME1P48163 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ME1P48163 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ME1P48163 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ME1P48163 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ME1P48163 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ME1P48163 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ME1P48163 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ME1P48163 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ME1P48163 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ME1P48163 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ME1P48163 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ME1P48163 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ME1P48163 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ME1P48163 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ME1P48163 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ME1P48163 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ME1P48163 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ME1P48163 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ME1P48163 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ME1P48163 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ME1P48163 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ME1P48163 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ME1P48163 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ME1P48163 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ME1P48163 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ME1P48163 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ME1P48163 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ME1P48163 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ME1P48163 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ME1P48163 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ME1P48163 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ME1P48163 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ME1P48163 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ME1P48163 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ME1P48163 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ME1P48163 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ME1P48163 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ME1P48163 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ME1P48163 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ME1P48163 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ME1P48163 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ME1P48163 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ME1P48163 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ME1P48163 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ME1P48163 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ME1P48163 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ME1P48163 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ME1P48163 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ME1P48163 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ME1P48163 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ME1P48163 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ME1P48163 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ME1P48163 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ME1P48163 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ME1P48163 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ME1P48163 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ME1P48163 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ME1P48163 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ME1P48163 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ME1P48163 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ME1P48163 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ME1P48163 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ME1P48163 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ME1P48163 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ME1P48163 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ME1P48163 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ME1P48163 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ME1P48163 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ME1P48163 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ME1P48163 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ME1P48163 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms