Protein–RNA interactions for Protein: P47224

RABIF, Guanine nucleotide exchange factor MSS4, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABIFP47224 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RABIFP47224 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RABIFP47224 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RABIFP47224 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
RABIFP47224 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RABIFP47224 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RABIFP47224 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RABIFP47224 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RABIFP47224 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RABIFP47224 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RABIFP47224 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RABIFP47224 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RABIFP47224 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RABIFP47224 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RABIFP47224 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RABIFP47224 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RABIFP47224 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RABIFP47224 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RABIFP47224 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RABIFP47224 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RABIFP47224 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RABIFP47224 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RABIFP47224 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RABIFP47224 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RABIFP47224 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RABIFP47224 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RABIFP47224 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RABIFP47224 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RABIFP47224 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RABIFP47224 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RABIFP47224 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RABIFP47224 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RABIFP47224 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RABIFP47224 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RABIFP47224 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RABIFP47224 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RABIFP47224 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RABIFP47224 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RABIFP47224 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RABIFP47224 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RABIFP47224 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RABIFP47224 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RABIFP47224 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RABIFP47224 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RABIFP47224 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RABIFP47224 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RABIFP47224 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RABIFP47224 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RABIFP47224 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RABIFP47224 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RABIFP47224 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RABIFP47224 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RABIFP47224 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RABIFP47224 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RABIFP47224 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RABIFP47224 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RABIFP47224 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RABIFP47224 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RABIFP47224 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RABIFP47224 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RABIFP47224 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RABIFP47224 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABIFP47224 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABIFP47224 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABIFP47224 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABIFP47224 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABIFP47224 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABIFP47224 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABIFP47224 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RABIFP47224 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABIFP47224 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABIFP47224 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABIFP47224 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABIFP47224 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABIFP47224 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABIFP47224 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABIFP47224 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABIFP47224 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABIFP47224 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RABIFP47224 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABIFP47224 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABIFP47224 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABIFP47224 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABIFP47224 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABIFP47224 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABIFP47224 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABIFP47224 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABIFP47224 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RABIFP47224 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RABIFP47224 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RABIFP47224 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RABIFP47224 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABIFP47224 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABIFP47224 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABIFP47224 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABIFP47224 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RABIFP47224 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABIFP47224 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABIFP47224 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RABIFP47224 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms