Protein–RNA interactions for Protein: P47211

GALR1, Galanin receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALR1P47211 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GALR1P47211 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GALR1P47211 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GALR1P47211 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GALR1P47211 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GALR1P47211 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GALR1P47211 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GALR1P47211 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GALR1P47211 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GALR1P47211 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GALR1P47211 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GALR1P47211 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GALR1P47211 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GALR1P47211 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GALR1P47211 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GALR1P47211 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GALR1P47211 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GALR1P47211 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GALR1P47211 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GALR1P47211 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GALR1P47211 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GALR1P47211 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GALR1P47211 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GALR1P47211 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GALR1P47211 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GALR1P47211 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GALR1P47211 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GALR1P47211 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GALR1P47211 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GALR1P47211 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GALR1P47211 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GALR1P47211 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GALR1P47211 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GALR1P47211 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GALR1P47211 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GALR1P47211 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GALR1P47211 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GALR1P47211 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GALR1P47211 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GALR1P47211 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GALR1P47211 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GALR1P47211 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GALR1P47211 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GALR1P47211 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GALR1P47211 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GALR1P47211 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GALR1P47211 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GALR1P47211 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GALR1P47211 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GALR1P47211 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GALR1P47211 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GALR1P47211 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GALR1P47211 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GALR1P47211 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GALR1P47211 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GALR1P47211 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GALR1P47211 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GALR1P47211 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GALR1P47211 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GALR1P47211 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GALR1P47211 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GALR1P47211 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GALR1P47211 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GALR1P47211 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GALR1P47211 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GALR1P47211 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GALR1P47211 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GALR1P47211 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GALR1P47211 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GALR1P47211 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GALR1P47211 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GALR1P47211 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GALR1P47211 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GALR1P47211 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GALR1P47211 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GALR1P47211 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GALR1P47211 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GALR1P47211 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GALR1P47211 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GALR1P47211 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GALR1P47211 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GALR1P47211 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GALR1P47211 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GALR1P47211 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GALR1P47211 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GALR1P47211 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALR1P47211 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALR1P47211 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALR1P47211 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALR1P47211 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALR1P47211 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALR1P47211 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALR1P47211 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALR1P47211 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALR1P47211 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALR1P47211 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALR1P47211 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GALR1P47211 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GALR1P47211 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GALR1P47211 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms