Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GNPDA1P46926 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GNPDA1P46926 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GNPDA1P46926 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GNPDA1P46926 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GNPDA1P46926 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GNPDA1P46926 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GNPDA1P46926 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GNPDA1P46926 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GNPDA1P46926 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GNPDA1P46926 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GNPDA1P46926 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GNPDA1P46926 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GNPDA1P46926 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GNPDA1P46926 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GNPDA1P46926 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GNPDA1P46926 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GNPDA1P46926 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GNPDA1P46926 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GNPDA1P46926 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GNPDA1P46926 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GNPDA1P46926 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GNPDA1P46926 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GNPDA1P46926 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GNPDA1P46926 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNPDA1P46926 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNPDA1P46926 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNPDA1P46926 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNPDA1P46926 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GNPDA1P46926 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GNPDA1P46926 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GNPDA1P46926 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNPDA1P46926 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNPDA1P46926 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNPDA1P46926 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNPDA1P46926 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GNPDA1P46926 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNPDA1P46926 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNPDA1P46926 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNPDA1P46926 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNPDA1P46926 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNPDA1P46926 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNPDA1P46926 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNPDA1P46926 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNPDA1P46926 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNPDA1P46926 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNPDA1P46926 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNPDA1P46926 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNPDA1P46926 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GNPDA1P46926 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
GNPDA1P46926 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GNPDA1P46926 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GNPDA1P46926 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GNPDA1P46926 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GNPDA1P46926 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GNPDA1P46926 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GNPDA1P46926 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GNPDA1P46926 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNPDA1P46926 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNPDA1P46926 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNPDA1P46926 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GNPDA1P46926 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNPDA1P46926 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNPDA1P46926 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNPDA1P46926 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNPDA1P46926 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNPDA1P46926 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNPDA1P46926 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNPDA1P46926 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GNPDA1P46926 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GNPDA1P46926 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GNPDA1P46926 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GNPDA1P46926 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GNPDA1P46926 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GNPDA1P46926 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GNPDA1P46926 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GNPDA1P46926 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GNPDA1P46926 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GNPDA1P46926 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GNPDA1P46926 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GNPDA1P46926 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GNPDA1P46926 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GNPDA1P46926 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GNPDA1P46926 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GNPDA1P46926 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GNPDA1P46926 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GNPDA1P46926 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GNPDA1P46926 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GNPDA1P46926 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GNPDA1P46926 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GNPDA1P46926 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GNPDA1P46926 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GNPDA1P46926 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GNPDA1P46926 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GNPDA1P46926 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GNPDA1P46926 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GNPDA1P46926 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GNPDA1P46926 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GNPDA1P46926 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GNPDA1P46926 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms