Protein–RNA interactions for Protein: P45844

ABCG1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG1P45844 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ABCG1P45844 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCG1P45844 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCG1P45844 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCG1P45844 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ABCG1P45844 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCG1P45844 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCG1P45844 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCG1P45844 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCG1P45844 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCG1P45844 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCG1P45844 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCG1P45844 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCG1P45844 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ABCG1P45844 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ABCG1P45844 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCG1P45844 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCG1P45844 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCG1P45844 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCG1P45844 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCG1P45844 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ABCG1P45844 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCG1P45844 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCG1P45844 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCG1P45844 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCG1P45844 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCG1P45844 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCG1P45844 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCG1P45844 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCG1P45844 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCG1P45844 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCG1P45844 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCG1P45844 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ABCG1P45844 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCG1P45844 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCG1P45844 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCG1P45844 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCG1P45844 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCG1P45844 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCG1P45844 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCG1P45844 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCG1P45844 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCG1P45844 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCG1P45844 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ABCG1P45844 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCG1P45844 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCG1P45844 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCG1P45844 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCG1P45844 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCG1P45844 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCG1P45844 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCG1P45844 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCG1P45844 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCG1P45844 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ABCG1P45844 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCG1P45844 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCG1P45844 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCG1P45844 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCG1P45844 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCG1P45844 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCG1P45844 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCG1P45844 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCG1P45844 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ABCG1P45844 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCG1P45844 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCG1P45844 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCG1P45844 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCG1P45844 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ABCG1P45844 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ABCG1P45844 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCG1P45844 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCG1P45844 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCG1P45844 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCG1P45844 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCG1P45844 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCG1P45844 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCG1P45844 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ABCG1P45844 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCG1P45844 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCG1P45844 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCG1P45844 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCG1P45844 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCG1P45844 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCG1P45844 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCG1P45844 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCG1P45844 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCG1P45844 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCG1P45844 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCG1P45844 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCG1P45844 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ABCG1P45844 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCG1P45844 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCG1P45844 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCG1P45844 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ABCG1P45844 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCG1P45844 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCG1P45844 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCG1P45844 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCG1P45844 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ABCG1P45844 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms