Protein–RNA interactions for Protein: P43308

SSR2, Translocon-associated protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR2P43308 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSR2P43308 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSR2P43308 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSR2P43308 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSR2P43308 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSR2P43308 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSR2P43308 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSR2P43308 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SSR2P43308 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSR2P43308 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSR2P43308 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSR2P43308 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSR2P43308 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SSR2P43308 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSR2P43308 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSR2P43308 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSR2P43308 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSR2P43308 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SSR2P43308 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SSR2P43308 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSR2P43308 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSR2P43308 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSR2P43308 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSR2P43308 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSR2P43308 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSR2P43308 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SSR2P43308 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SSR2P43308 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SSR2P43308 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SSR2P43308 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSR2P43308 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSR2P43308 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSR2P43308 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSR2P43308 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSR2P43308 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSR2P43308 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SSR2P43308 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSR2P43308 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSR2P43308 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSR2P43308 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSR2P43308 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSR2P43308 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSR2P43308 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSR2P43308 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSR2P43308 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSR2P43308 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSR2P43308 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSR2P43308 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSR2P43308 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SSR2P43308 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSR2P43308 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSR2P43308 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SSR2P43308 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSR2P43308 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSR2P43308 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSR2P43308 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SSR2P43308 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSR2P43308 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSR2P43308 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSR2P43308 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SSR2P43308 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSR2P43308 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSR2P43308 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSR2P43308 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SSR2P43308 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSR2P43308 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSR2P43308 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSR2P43308 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSR2P43308 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSR2P43308 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SSR2P43308 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSR2P43308 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSR2P43308 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSR2P43308 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSR2P43308 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSR2P43308 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSR2P43308 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SSR2P43308 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSR2P43308 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSR2P43308 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSR2P43308 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSR2P43308 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSR2P43308 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSR2P43308 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSR2P43308 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSR2P43308 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSR2P43308 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SSR2P43308 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSR2P43308 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSR2P43308 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSR2P43308 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSR2P43308 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSR2P43308 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSR2P43308 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSR2P43308 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SSR2P43308 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSR2P43308 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSR2P43308 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSR2P43308 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SSR2P43308 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms