Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL35P42766 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL35P42766 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RPL35P42766 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL35P42766 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL35P42766 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL35P42766 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL35P42766 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL35P42766 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL35P42766 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL35P42766 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL35P42766 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL35P42766 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL35P42766 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL35P42766 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL35P42766 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL35P42766 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RPL35P42766 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL35P42766 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL35P42766 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL35P42766 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL35P42766 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL35P42766 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL35P42766 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL35P42766 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL35P42766 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL35P42766 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL35P42766 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RPL35P42766 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL35P42766 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL35P42766 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL35P42766 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL35P42766 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL35P42766 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL35P42766 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL35P42766 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL35P42766 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL35P42766 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL35P42766 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL35P42766 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL35P42766 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL35P42766 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL35P42766 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL35P42766 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL35P42766 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL35P42766 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RPL35P42766 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPL35P42766 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPL35P42766 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPL35P42766 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPL35P42766 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPL35P42766 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPL35P42766 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPL35P42766 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RPL35P42766 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPL35P42766 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPL35P42766 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RPL35P42766 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
RPL35P42766 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
RPL35P42766 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL35P42766 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL35P42766 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL35P42766 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL35P42766 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL35P42766 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL35P42766 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL35P42766 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RPL35P42766 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL35P42766 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL35P42766 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL35P42766 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL35P42766 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL35P42766 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL35P42766 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL35P42766 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL35P42766 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL35P42766 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RPL35P42766 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL35P42766 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL35P42766 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL35P42766 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL35P42766 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL35P42766 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL35P42766 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL35P42766 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL35P42766 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL35P42766 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL35P42766 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL35P42766 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL35P42766 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL35P42766 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL35P42766 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL35P42766 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL35P42766 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL35P42766 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RPL35P42766 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL35P42766 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL35P42766 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL35P42766 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL35P42766 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms