Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTRLP40313 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTRLP40313 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTRLP40313 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTRLP40313 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTRLP40313 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTRLP40313 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTRLP40313 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTRLP40313 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTRLP40313 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTRLP40313 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTRLP40313 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTRLP40313 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTRLP40313 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CTRLP40313 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTRLP40313 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTRLP40313 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CTRLP40313 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTRLP40313 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTRLP40313 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTRLP40313 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTRLP40313 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTRLP40313 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTRLP40313 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTRLP40313 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTRLP40313 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTRLP40313 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTRLP40313 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTRLP40313 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTRLP40313 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTRLP40313 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTRLP40313 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTRLP40313 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTRLP40313 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTRLP40313 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTRLP40313 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTRLP40313 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTRLP40313 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTRLP40313 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTRLP40313 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTRLP40313 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTRLP40313 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTRLP40313 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTRLP40313 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTRLP40313 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CTRLP40313 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTRLP40313 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTRLP40313 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTRLP40313 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTRLP40313 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTRLP40313 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTRLP40313 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTRLP40313 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTRLP40313 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTRLP40313 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CTRLP40313 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CTRLP40313 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CTRLP40313 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CTRLP40313 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTRLP40313 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CTRLP40313 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTRLP40313 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTRLP40313 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTRLP40313 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTRLP40313 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTRLP40313 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTRLP40313 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTRLP40313 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTRLP40313 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTRLP40313 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTRLP40313 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CTRLP40313 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTRLP40313 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTRLP40313 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTRLP40313 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTRLP40313 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTRLP40313 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CTRLP40313 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTRLP40313 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTRLP40313 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTRLP40313 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTRLP40313 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTRLP40313 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTRLP40313 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CTRLP40313 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CTRLP40313 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTRLP40313 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTRLP40313 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTRLP40313 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTRLP40313 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTRLP40313 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CTRLP40313 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTRLP40313 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CTRLP40313 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTRLP40313 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTRLP40313 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTRLP40313 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTRLP40313 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTRLP40313 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTRLP40313 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms