Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPGP40121 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPGP40121 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPGP40121 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPGP40121 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPGP40121 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPGP40121 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPGP40121 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPGP40121 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPGP40121 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPGP40121 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPGP40121 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPGP40121 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPGP40121 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPGP40121 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPGP40121 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPGP40121 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPGP40121 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CAPGP40121 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPGP40121 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPGP40121 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPGP40121 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPGP40121 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPGP40121 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPGP40121 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPGP40121 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPGP40121 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPGP40121 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPGP40121 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPGP40121 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPGP40121 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CAPGP40121 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPGP40121 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPGP40121 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPGP40121 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPGP40121 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPGP40121 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPGP40121 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPGP40121 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPGP40121 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CAPGP40121 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPGP40121 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPGP40121 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPGP40121 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPGP40121 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPGP40121 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPGP40121 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CAPGP40121 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPGP40121 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPGP40121 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPGP40121 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPGP40121 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPGP40121 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPGP40121 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CAPGP40121 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAPGP40121 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAPGP40121 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CAPGP40121 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPGP40121 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPGP40121 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPGP40121 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPGP40121 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAPGP40121 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPGP40121 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPGP40121 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPGP40121 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPGP40121 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPGP40121 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPGP40121 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPGP40121 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPGP40121 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPGP40121 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPGP40121 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPGP40121 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPGP40121 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPGP40121 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAPGP40121 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPGP40121 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPGP40121 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPGP40121 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPGP40121 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPGP40121 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPGP40121 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPGP40121 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPGP40121 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPGP40121 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPGP40121 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPGP40121 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPGP40121 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPGP40121 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPGP40121 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPGP40121 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPGP40121 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPGP40121 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPGP40121 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPGP40121 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPGP40121 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPGP40121 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPGP40121 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPGP40121 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms