Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNCAP37840 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNCAP37840 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNCAP37840 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNCAP37840 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNCAP37840 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNCAP37840 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNCAP37840 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNCAP37840 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNCAP37840 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNCAP37840 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNCAP37840 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNCAP37840 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNCAP37840 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNCAP37840 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNCAP37840 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNCAP37840 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNCAP37840 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNCAP37840 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNCAP37840 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNCAP37840 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNCAP37840 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNCAP37840 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNCAP37840 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNCAP37840 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNCAP37840 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNCAP37840 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNCAP37840 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNCAP37840 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNCAP37840 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNCAP37840 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNCAP37840 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNCAP37840 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNCAP37840 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNCAP37840 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNCAP37840 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNCAP37840 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNCAP37840 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNCAP37840 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNCAP37840 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNCAP37840 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNCAP37840 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNCAP37840 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNCAP37840 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNCAP37840 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNCAP37840 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNCAP37840 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNCAP37840 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNCAP37840 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNCAP37840 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNCAP37840 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNCAP37840 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNCAP37840 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNCAP37840 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNCAP37840 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNCAP37840 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNCAP37840 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNCAP37840 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SNCAP37840 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNCAP37840 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNCAP37840 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNCAP37840 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SNCAP37840 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNCAP37840 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNCAP37840 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNCAP37840 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNCAP37840 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNCAP37840 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNCAP37840 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNCAP37840 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNCAP37840 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNCAP37840 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNCAP37840 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNCAP37840 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNCAP37840 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNCAP37840 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNCAP37840 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNCAP37840 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNCAP37840 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNCAP37840 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNCAP37840 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNCAP37840 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SNCAP37840 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNCAP37840 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNCAP37840 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNCAP37840 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNCAP37840 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNCAP37840 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNCAP37840 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNCAP37840 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNCAP37840 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNCAP37840 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNCAP37840 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNCAP37840 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNCAP37840 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNCAP37840 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNCAP37840 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNCAP37840 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNCAP37840 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNCAP37840 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms