Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYH11P35749 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYH11P35749 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYH11P35749 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYH11P35749 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MYH11P35749 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MYH11P35749 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYH11P35749 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MYH11P35749 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYH11P35749 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYH11P35749 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYH11P35749 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYH11P35749 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYH11P35749 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYH11P35749 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYH11P35749 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYH11P35749 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MYH11P35749 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYH11P35749 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
MYH11P35749 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYH11P35749 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYH11P35749 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYH11P35749 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MYH11P35749 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MYH11P35749 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MYH11P35749 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MYH11P35749 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MYH11P35749 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MYH11P35749 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MYH11P35749 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MYH11P35749 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYH11P35749 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYH11P35749 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYH11P35749 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYH11P35749 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
MYH11P35749 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYH11P35749 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MYH11P35749 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MYH11P35749 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MYH11P35749 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MYH11P35749 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MYH11P35749 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MYH11P35749 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MYH11P35749 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYH11P35749 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYH11P35749 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MYH11P35749 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MYH11P35749 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MYH11P35749 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MYH11P35749 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MYH11P35749 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MYH11P35749 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MYH11P35749 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MYH11P35749 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MYH11P35749 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MYH11P35749 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MYH11P35749 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MYH11P35749 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MYH11P35749 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MYH11P35749 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MYH11P35749 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MYH11P35749 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
MYH11P35749 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MYH11P35749 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MYH11P35749 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MYH11P35749 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MYH11P35749 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MYH11P35749 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MYH11P35749 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MYH11P35749 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
MYH11P35749 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MYH11P35749 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MYH11P35749 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MYH11P35749 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MYH11P35749 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MYH11P35749 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MYH11P35749 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MYH11P35749 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MYH11P35749 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MYH11P35749 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MYH11P35749 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MYH11P35749 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYH11P35749 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYH11P35749 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYH11P35749 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYH11P35749 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYH11P35749 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MYH11P35749 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
MYH11P35749 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MYH11P35749 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MYH11P35749 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MYH11P35749 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MYH11P35749 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MYH11P35749 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MYH11P35749 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MYH11P35749 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MYH11P35749 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MYH11P35749 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MYH11P35749 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MYH11P35749 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms