Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFC1P35251 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFC1P35251 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFC1P35251 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RFC1P35251 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFC1P35251 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFC1P35251 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RFC1P35251 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFC1P35251 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFC1P35251 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RFC1P35251 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFC1P35251 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFC1P35251 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFC1P35251 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFC1P35251 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFC1P35251 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFC1P35251 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFC1P35251 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFC1P35251 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFC1P35251 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFC1P35251 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFC1P35251 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFC1P35251 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RFC1P35251 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFC1P35251 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFC1P35251 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFC1P35251 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFC1P35251 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RFC1P35251 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFC1P35251 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFC1P35251 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFC1P35251 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RFC1P35251 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFC1P35251 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFC1P35251 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFC1P35251 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFC1P35251 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFC1P35251 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RFC1P35251 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RFC1P35251 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RFC1P35251 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RFC1P35251 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RFC1P35251 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RFC1P35251 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RFC1P35251 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RFC1P35251 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RFC1P35251 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RFC1P35251 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RFC1P35251 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RFC1P35251 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RFC1P35251 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RFC1P35251 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFC1P35251 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFC1P35251 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFC1P35251 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFC1P35251 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFC1P35251 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFC1P35251 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFC1P35251 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFC1P35251 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RFC1P35251 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RFC1P35251 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFC1P35251 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFC1P35251 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFC1P35251 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFC1P35251 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFC1P35251 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFC1P35251 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RFC1P35251 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFC1P35251 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFC1P35251 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RFC1P35251 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFC1P35251 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFC1P35251 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFC1P35251 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFC1P35251 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RFC1P35251 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFC1P35251 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFC1P35251 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFC1P35251 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFC1P35251 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFC1P35251 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RFC1P35251 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFC1P35251 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFC1P35251 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFC1P35251 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFC1P35251 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFC1P35251 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RFC1P35251 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFC1P35251 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFC1P35251 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFC1P35251 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFC1P35251 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RFC1P35251 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFC1P35251 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFC1P35251 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFC1P35251 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RFC1P35251 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFC1P35251 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RFC1P35251 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms