Protein–RNA interactions for Protein: P33241

LSP1, Lymphocyte-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSP1P33241 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LSP1P33241 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LSP1P33241 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LSP1P33241 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LSP1P33241 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LSP1P33241 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LSP1P33241 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LSP1P33241 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LSP1P33241 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LSP1P33241 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LSP1P33241 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LSP1P33241 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LSP1P33241 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LSP1P33241 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LSP1P33241 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LSP1P33241 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LSP1P33241 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LSP1P33241 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LSP1P33241 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LSP1P33241 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LSP1P33241 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LSP1P33241 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LSP1P33241 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LSP1P33241 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LSP1P33241 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LSP1P33241 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LSP1P33241 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LSP1P33241 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LSP1P33241 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LSP1P33241 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LSP1P33241 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LSP1P33241 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LSP1P33241 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LSP1P33241 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LSP1P33241 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LSP1P33241 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LSP1P33241 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LSP1P33241 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LSP1P33241 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LSP1P33241 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LSP1P33241 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LSP1P33241 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LSP1P33241 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LSP1P33241 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LSP1P33241 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LSP1P33241 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LSP1P33241 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LSP1P33241 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LSP1P33241 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LSP1P33241 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LSP1P33241 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LSP1P33241 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSP1P33241 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSP1P33241 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSP1P33241 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSP1P33241 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSP1P33241 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSP1P33241 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSP1P33241 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSP1P33241 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSP1P33241 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSP1P33241 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSP1P33241 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LSP1P33241 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LSP1P33241 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LSP1P33241 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LSP1P33241 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LSP1P33241 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LSP1P33241 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LSP1P33241 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LSP1P33241 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LSP1P33241 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LSP1P33241 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LSP1P33241 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LSP1P33241 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LSP1P33241 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LSP1P33241 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LSP1P33241 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LSP1P33241 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LSP1P33241 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LSP1P33241 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LSP1P33241 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LSP1P33241 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LSP1P33241 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LSP1P33241 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LSP1P33241 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LSP1P33241 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LSP1P33241 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LSP1P33241 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LSP1P33241 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LSP1P33241 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LSP1P33241 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LSP1P33241 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LSP1P33241 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LSP1P33241 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LSP1P33241 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LSP1P33241 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LSP1P33241 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LSP1P33241 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LSP1P33241 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms