Protein–RNA interactions for Protein: P32578

SIP1, SNF1 protein kinase subunit beta-1, yeast

Predictions only

Length 815 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SIP1	P32578	MRPL23	YOR150W	492 nt		5.3	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	LDB16	YCL005W	771 nt		5.3	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	TRP3	YKL211C	1455 nt		5.3	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	YGR054W	YGR054W	1929 nt		5.3	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	LCB2	YDR062W	1686 nt		5.3	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	VBA1	YMR088C	1689 nt		5.3	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	FAL1	YDR021W	1200 nt		5.29	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	UBC6	YER100W	753 nt		5.29	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	YLR311C	YLR311C	348 nt		5.29	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	SML1	YML058W	315 nt		5.29	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	ADD37	YMR184W	597 nt		5.29	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	PSH1	YOL054W	1221 nt		5.29	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	YOL163W	YOL163W	510 nt		5.29	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	KTR1	YOR099W	1182 nt		5.29	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	RPL21A	YBR191W	483 nt		5.29	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	SPC97	YHR172W	2472 nt		5.29	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	CLB5	YPR120C	1308 nt		5.28	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	ABZ1	YNR033W	2364 nt		5.28	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	RMD1	YDL001W	1293 nt		5.28	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	TMT1	YER175C	900 nt		5.28	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	IPI1	YHR085W	1005 nt		5.28	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	MDE1	YJR024C	735 nt		5.28	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	YKL077W	YKL077W	1179 nt		5.28	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	CTR3	YLR411W	726 nt		5.28	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	JNM1	YMR294W	1122 nt		5.28	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	VMA4	YOR332W	702 nt		5.28	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	SUI3	YPL237W	858 nt		5.28	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	CKS1	YBR135W	453 nt		5.28	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	MNN5	YJL186W	1761 nt		5.28	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	TUL1	YKL034W	2277 nt		5.28	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	MRE11	YMR224C	2079 nt		5.28	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	MAL11	YGR289C	1851 nt		5.28	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	YHK8	YHR048W	1545 nt		5.28	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	YAP1801	YHR161C	1914 nt		5.27	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	PRE3	YJL001W	648 nt		5.27	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	LCB3	YJL134W	1230 nt		5.27	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	TOM40	YMR203W	1164 nt		5.27	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	RUF23	RUF23	254 nt		5.27	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	PFA4	YOL003C	1137 nt		5.27	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	VTC2	YFL004W	2487 nt		5.26	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	OXP1	YKL215C	3861 nt		5.26	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	RGT1	YKL038W	3513 nt		5.26	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	HIR1	YBL008W	2523 nt		5.26	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	OMS1	YDR316W	1416 nt		5.26	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	MDH3	YDL078C	1032 nt		5.26	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	IPK1	YDR315C	846 nt		5.26	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	ASP1	YDR321W	1146 nt		5.26	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	YER134C	YER134C	537 nt		5.26	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	SPO16	YHR153C	597 nt		5.26	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	AIM46	YHR199C	933 nt		5.26	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	YHR213W-B	YHR213W-B	300 nt		5.26	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	YRB2	YIL063C	984 nt		5.26	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	YJR056C	YJR056C	711 nt		5.26	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	POP5	YAL033W	522 nt		5.26	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	YKL102C	YKL102C	306 nt		5.26	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	YAR064W	YAR064W	300 nt		5.26	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	ZIM17	YNL310C	525 nt		5.26	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	ENV9	YOR246C	993 nt		5.26	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	FIT2	YOR382W	462 nt		5.26	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	GPI2	YPL076W	843 nt		5.26	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	YJL163C	YJL163C	1668 nt		5.26	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	TBF1	YPL128C	1689 nt		5.26	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	YLL067C	YLL067C	3618 nt		5.26	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	SSK22	YCR073C	3996 nt		5.25	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	YFR052C-A	YFR052C-A	306 nt		5.25	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	ARD1	YHR013C	717 nt		5.25	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	LYS1	YIR034C	1122 nt		5.25	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	YOL131W	YOL131W	327 nt		5.25	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	FHL1	YPR104C	2811 nt		5.25	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	MCH1	YDL054C	1461 nt		5.25	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	VTH1	YIL173W	4650 nt		5.24	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	VTH2	YJL222W	4650 nt		5.24	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	GRX6	YDL010W	696 nt		5.24	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	NSE3	YDR288W	912 nt		5.24	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	VMA3	YEL027W	483 nt		5.24	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	SAY1	YGR263C	1275 nt		5.24	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	RPE1	YJL121C	717 nt		5.24	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	MHO1	YJR008W	1017 nt		5.24	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	YOL046C	YOL046C	675 nt		5.24	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	SFT2	YBL102W	648 nt		5.24	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	VAM3	YOR106W	852 nt		5.24	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	FSF1	YOR271C	984 nt		5.24	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	YDC1	YPL087W	954 nt		5.24	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	GLN1	YPR035W	1113 nt		5.24	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	ISA2	YPR067W	558 nt		5.24	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	YPR076W	YPR076W	375 nt		5.24	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	SUE1	YPR151C	621 nt		5.24	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	FKH1	YIL131C	1455 nt		5.24	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	NUP1	YOR098C	3231 nt		5.23	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	YDL085C-A	YDL085C-A	207 nt		5.23	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	CHO1	YER026C	831 nt		5.23	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	PDE1	YGL248W	1110 nt		5.23	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	YKL107W	YKL107W	930 nt		5.23	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	YNL143C	YNL143C	393 nt		5.23	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	DSC2	YOL073C	969 nt		5.23	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	MCP1	YOR228C	909 nt		5.23	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	YOR292C	YOR292C	930 nt		5.23	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	VPS28	YPL065W	729 nt		5.23	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	IPI3	YNL182C	1668 nt		5.23	□□□□□ -1.57
SIP1	P32578	RPT1	YKL145W	1404 nt		5.23	□□□□□ -1.57

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.1 ms