Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CXCR5P32302 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CXCR5P32302 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CXCR5P32302 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CXCR5P32302 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CXCR5P32302 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CXCR5P32302 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CXCR5P32302 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CXCR5P32302 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CXCR5P32302 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CXCR5P32302 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CXCR5P32302 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CXCR5P32302 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CXCR5P32302 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CXCR5P32302 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CXCR5P32302 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CXCR5P32302 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CXCR5P32302 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CXCR5P32302 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CXCR5P32302 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CXCR5P32302 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CXCR5P32302 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CXCR5P32302 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CXCR5P32302 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CXCR5P32302 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CXCR5P32302 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CXCR5P32302 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CXCR5P32302 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CXCR5P32302 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CXCR5P32302 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CXCR5P32302 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CXCR5P32302 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CXCR5P32302 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CXCR5P32302 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CXCR5P32302 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CXCR5P32302 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CXCR5P32302 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CXCR5P32302 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CXCR5P32302 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CXCR5P32302 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CXCR5P32302 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CXCR5P32302 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CXCR5P32302 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CXCR5P32302 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CXCR5P32302 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CXCR5P32302 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CXCR5P32302 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CXCR5P32302 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CXCR5P32302 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CXCR5P32302 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CXCR5P32302 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CXCR5P32302 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CXCR5P32302 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CXCR5P32302 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CXCR5P32302 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CXCR5P32302 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CXCR5P32302 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CXCR5P32302 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CXCR5P32302 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CXCR5P32302 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CXCR5P32302 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CXCR5P32302 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CXCR5P32302 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CXCR5P32302 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CXCR5P32302 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CXCR5P32302 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CXCR5P32302 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CXCR5P32302 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CXCR5P32302 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CXCR5P32302 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CXCR5P32302 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CXCR5P32302 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CXCR5P32302 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CXCR5P32302 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CXCR5P32302 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CXCR5P32302 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CXCR5P32302 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CXCR5P32302 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CXCR5P32302 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CXCR5P32302 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CXCR5P32302 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CXCR5P32302 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CXCR5P32302 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CXCR5P32302 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CXCR5P32302 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CXCR5P32302 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CXCR5P32302 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CXCR5P32302 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CXCR5P32302 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CXCR5P32302 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CXCR5P32302 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CXCR5P32302 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CXCR5P32302 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CXCR5P32302 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CXCR5P32302 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CXCR5P32302 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CXCR5P32302 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CXCR5P32302 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CXCR5P32302 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CXCR5P32302 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms