Protein–RNA interactions for Protein: P30876

POLR2B, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2BP30876 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR2BP30876 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR2BP30876 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR2BP30876 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR2BP30876 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR2BP30876 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR2BP30876 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR2BP30876 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR2BP30876 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR2BP30876 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR2BP30876 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR2BP30876 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR2BP30876 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR2BP30876 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR2BP30876 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR2BP30876 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR2BP30876 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR2BP30876 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR2BP30876 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR2BP30876 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR2BP30876 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2BP30876 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2BP30876 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2BP30876 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2BP30876 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2BP30876 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2BP30876 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR2BP30876 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2BP30876 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2BP30876 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2BP30876 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2BP30876 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2BP30876 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2BP30876 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2BP30876 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2BP30876 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2BP30876 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR2BP30876 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR2BP30876 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR2BP30876 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR2BP30876 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR2BP30876 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR2BP30876 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR2BP30876 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2BP30876 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2BP30876 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2BP30876 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2BP30876 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2BP30876 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2BP30876 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2BP30876 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2BP30876 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2BP30876 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2BP30876 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2BP30876 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2BP30876 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2BP30876 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2BP30876 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR2BP30876 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR2BP30876 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR2BP30876 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR2BP30876 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR2BP30876 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR2BP30876 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR2BP30876 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR2BP30876 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR2BP30876 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR2BP30876 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR2BP30876 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2BP30876 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2BP30876 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2BP30876 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2BP30876 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2BP30876 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR2BP30876 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR2BP30876 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR2BP30876 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR2BP30876 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR2BP30876 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR2BP30876 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR2BP30876 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR2BP30876 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR2BP30876 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR2BP30876 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR2BP30876 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR2BP30876 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR2BP30876 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR2BP30876 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR2BP30876 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR2BP30876 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR2BP30876 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR2BP30876 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2BP30876 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2BP30876 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2BP30876 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2BP30876 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR2BP30876 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2BP30876 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2BP30876 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR2BP30876 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms