Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECHS1P30084 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECHS1P30084 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECHS1P30084 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ECHS1P30084 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECHS1P30084 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECHS1P30084 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECHS1P30084 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECHS1P30084 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECHS1P30084 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECHS1P30084 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECHS1P30084 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ECHS1P30084 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ECHS1P30084 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECHS1P30084 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECHS1P30084 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECHS1P30084 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECHS1P30084 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECHS1P30084 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECHS1P30084 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ECHS1P30084 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECHS1P30084 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECHS1P30084 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECHS1P30084 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECHS1P30084 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECHS1P30084 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECHS1P30084 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ECHS1P30084 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECHS1P30084 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECHS1P30084 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECHS1P30084 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ECHS1P30084 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECHS1P30084 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECHS1P30084 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECHS1P30084 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECHS1P30084 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECHS1P30084 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECHS1P30084 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECHS1P30084 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ECHS1P30084 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ECHS1P30084 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ECHS1P30084 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ECHS1P30084 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ECHS1P30084 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ECHS1P30084 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ECHS1P30084 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ECHS1P30084 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ECHS1P30084 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ECHS1P30084 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECHS1P30084 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECHS1P30084 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECHS1P30084 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECHS1P30084 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECHS1P30084 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECHS1P30084 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECHS1P30084 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECHS1P30084 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECHS1P30084 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ECHS1P30084 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ECHS1P30084 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ECHS1P30084 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ECHS1P30084 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ECHS1P30084 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ECHS1P30084 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ECHS1P30084 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ECHS1P30084 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ECHS1P30084 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ECHS1P30084 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ECHS1P30084 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ECHS1P30084 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ECHS1P30084 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ECHS1P30084 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ECHS1P30084 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ECHS1P30084 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ECHS1P30084 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ECHS1P30084 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ECHS1P30084 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ECHS1P30084 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ECHS1P30084 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ECHS1P30084 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ECHS1P30084 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ECHS1P30084 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ECHS1P30084 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ECHS1P30084 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECHS1P30084 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECHS1P30084 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECHS1P30084 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECHS1P30084 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECHS1P30084 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECHS1P30084 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ECHS1P30084 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECHS1P30084 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ECHS1P30084 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ECHS1P30084 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ECHS1P30084 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ECHS1P30084 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ECHS1P30084 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ECHS1P30084 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ECHS1P30084 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ECHS1P30084 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms