Protein–RNA interactions for Protein: P28566

HTR1E, 5-hydroxytryptamine receptor 1E, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1EP28566 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTR1EP28566 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTR1EP28566 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTR1EP28566 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTR1EP28566 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HTR1EP28566 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HTR1EP28566 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTR1EP28566 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTR1EP28566 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HTR1EP28566 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTR1EP28566 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTR1EP28566 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTR1EP28566 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTR1EP28566 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTR1EP28566 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HTR1EP28566 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTR1EP28566 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTR1EP28566 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTR1EP28566 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTR1EP28566 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTR1EP28566 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTR1EP28566 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTR1EP28566 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTR1EP28566 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HTR1EP28566 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTR1EP28566 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HTR1EP28566 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTR1EP28566 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTR1EP28566 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTR1EP28566 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTR1EP28566 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTR1EP28566 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTR1EP28566 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTR1EP28566 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTR1EP28566 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTR1EP28566 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTR1EP28566 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HTR1EP28566 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTR1EP28566 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTR1EP28566 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTR1EP28566 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTR1EP28566 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTR1EP28566 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTR1EP28566 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTR1EP28566 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTR1EP28566 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HTR1EP28566 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTR1EP28566 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTR1EP28566 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTR1EP28566 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTR1EP28566 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTR1EP28566 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTR1EP28566 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTR1EP28566 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTR1EP28566 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HTR1EP28566 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTR1EP28566 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HTR1EP28566 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HTR1EP28566 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HTR1EP28566 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HTR1EP28566 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HTR1EP28566 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HTR1EP28566 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms