Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NMBRP28336 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NMBRP28336 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NMBRP28336 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NMBRP28336 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NMBRP28336 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NMBRP28336 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NMBRP28336 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NMBRP28336 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NMBRP28336 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NMBRP28336 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NMBRP28336 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NMBRP28336 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NMBRP28336 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NMBRP28336 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NMBRP28336 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NMBRP28336 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NMBRP28336 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NMBRP28336 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NMBRP28336 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NMBRP28336 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NMBRP28336 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NMBRP28336 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NMBRP28336 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NMBRP28336 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NMBRP28336 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NMBRP28336 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NMBRP28336 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NMBRP28336 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NMBRP28336 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NMBRP28336 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NMBRP28336 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NMBRP28336 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NMBRP28336 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NMBRP28336 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NMBRP28336 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NMBRP28336 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NMBRP28336 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NMBRP28336 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NMBRP28336 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NMBRP28336 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NMBRP28336 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NMBRP28336 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NMBRP28336 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NMBRP28336 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NMBRP28336 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NMBRP28336 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NMBRP28336 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NMBRP28336 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NMBRP28336 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NMBRP28336 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NMBRP28336 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NMBRP28336 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NMBRP28336 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NMBRP28336 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NMBRP28336 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NMBRP28336 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NMBRP28336 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NMBRP28336 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NMBRP28336 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NMBRP28336 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NMBRP28336 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NMBRP28336 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NMBRP28336 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NMBRP28336 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NMBRP28336 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NMBRP28336 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NMBRP28336 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NMBRP28336 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NMBRP28336 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NMBRP28336 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NMBRP28336 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NMBRP28336 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NMBRP28336 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NMBRP28336 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NMBRP28336 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NMBRP28336 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NMBRP28336 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NMBRP28336 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NMBRP28336 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NMBRP28336 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NMBRP28336 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NMBRP28336 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NMBRP28336 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NMBRP28336 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NMBRP28336 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NMBRP28336 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NMBRP28336 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NMBRP28336 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NMBRP28336 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NMBRP28336 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NMBRP28336 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NMBRP28336 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NMBRP28336 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NMBRP28336 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NMBRP28336 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NMBRP28336 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NMBRP28336 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NMBRP28336 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NMBRP28336 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
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