Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HTR2AP28223 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HTR2AP28223 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HTR2AP28223 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HTR2AP28223 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HTR2AP28223 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HTR2AP28223 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HTR2AP28223 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HTR2AP28223 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HTR2AP28223 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HTR2AP28223 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HTR2AP28223 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HTR2AP28223 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HTR2AP28223 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HTR2AP28223 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HTR2AP28223 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HTR2AP28223 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HTR2AP28223 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HTR2AP28223 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HTR2AP28223 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HTR2AP28223 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HTR2AP28223 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HTR2AP28223 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HTR2AP28223 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HTR2AP28223 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HTR2AP28223 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HTR2AP28223 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HTR2AP28223 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HTR2AP28223 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HTR2AP28223 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HTR2AP28223 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HTR2AP28223 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HTR2AP28223 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HTR2AP28223 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTR2AP28223 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTR2AP28223 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HTR2AP28223 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTR2AP28223 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTR2AP28223 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTR2AP28223 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTR2AP28223 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTR2AP28223 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTR2AP28223 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTR2AP28223 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTR2AP28223 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HTR2AP28223 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HTR2AP28223 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms