Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB9P28065 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB9P28065 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB9P28065 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB9P28065 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB9P28065 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB9P28065 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMB9P28065 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMB9P28065 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMB9P28065 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMB9P28065 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMB9P28065 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PSMB9P28065 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMB9P28065 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMB9P28065 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMB9P28065 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMB9P28065 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PSMB9P28065 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PSMB9P28065 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMB9P28065 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMB9P28065 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMB9P28065 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMB9P28065 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PSMB9P28065 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMB9P28065 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMB9P28065 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMB9P28065 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PSMB9P28065 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMB9P28065 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMB9P28065 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMB9P28065 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMB9P28065 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMB9P28065 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMB9P28065 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMB9P28065 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMB9P28065 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PSMB9P28065 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMB9P28065 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMB9P28065 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMB9P28065 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMB9P28065 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMB9P28065 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PSMB9P28065 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMB9P28065 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMB9P28065 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMB9P28065 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMB9P28065 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMB9P28065 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMB9P28065 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMB9P28065 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMB9P28065 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMB9P28065 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PSMB9P28065 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMB9P28065 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMB9P28065 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMB9P28065 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMB9P28065 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMB9P28065 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMB9P28065 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMB9P28065 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMB9P28065 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMB9P28065 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMB9P28065 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PSMB9P28065 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PSMB9P28065 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PSMB9P28065 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMB9P28065 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMB9P28065 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMB9P28065 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMB9P28065 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMB9P28065 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMB9P28065 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMB9P28065 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMB9P28065 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMB9P28065 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMB9P28065 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMB9P28065 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMB9P28065 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMB9P28065 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMB9P28065 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMB9P28065 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMB9P28065 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMB9P28065 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMB9P28065 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMB9P28065 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMB9P28065 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMB9P28065 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMB9P28065 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMB9P28065 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMB9P28065 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMB9P28065 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMB9P28065 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMB9P28065 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMB9P28065 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMB9P28065 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMB9P28065 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMB9P28065 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMB9P28065 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMB9P28065 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMB9P28065 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms