Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD27P26842 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD27P26842 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD27P26842 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD27P26842 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD27P26842 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD27P26842 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD27P26842 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CD27P26842 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD27P26842 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CD27P26842 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD27P26842 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD27P26842 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD27P26842 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD27P26842 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD27P26842 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD27P26842 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD27P26842 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD27P26842 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD27P26842 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD27P26842 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD27P26842 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD27P26842 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD27P26842 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD27P26842 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD27P26842 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD27P26842 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD27P26842 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD27P26842 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD27P26842 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD27P26842 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD27P26842 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD27P26842 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD27P26842 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD27P26842 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD27P26842 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD27P26842 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD27P26842 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CD27P26842 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CD27P26842 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD27P26842 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CD27P26842 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD27P26842 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD27P26842 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD27P26842 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD27P26842 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD27P26842 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD27P26842 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD27P26842 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD27P26842 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD27P26842 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD27P26842 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD27P26842 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD27P26842 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD27P26842 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD27P26842 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD27P26842 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CD27P26842 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD27P26842 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CD27P26842 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CD27P26842 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD27P26842 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD27P26842 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD27P26842 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD27P26842 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD27P26842 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CD27P26842 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD27P26842 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD27P26842 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD27P26842 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD27P26842 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD27P26842 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD27P26842 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD27P26842 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD27P26842 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD27P26842 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CD27P26842 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD27P26842 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD27P26842 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD27P26842 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD27P26842 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD27P26842 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD27P26842 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD27P26842 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CD27P26842 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD27P26842 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD27P26842 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD27P26842 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD27P26842 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD27P26842 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD27P26842 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD27P26842 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD27P26842 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD27P26842 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD27P26842 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD27P26842 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD27P26842 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD27P26842 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD27P26842 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CD27P26842 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms