Protein–RNA interactions for Protein: P22736

NR4A1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A1P22736 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR4A1P22736 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NR4A1P22736 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR4A1P22736 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR4A1P22736 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR4A1P22736 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR4A1P22736 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR4A1P22736 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR4A1P22736 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR4A1P22736 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR4A1P22736 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR4A1P22736 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR4A1P22736 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR4A1P22736 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR4A1P22736 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR4A1P22736 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR4A1P22736 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR4A1P22736 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR4A1P22736 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR4A1P22736 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR4A1P22736 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR4A1P22736 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR4A1P22736 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR4A1P22736 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR4A1P22736 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR4A1P22736 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR4A1P22736 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR4A1P22736 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR4A1P22736 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR4A1P22736 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR4A1P22736 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR4A1P22736 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR4A1P22736 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR4A1P22736 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR4A1P22736 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR4A1P22736 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR4A1P22736 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms