Protein–RNA interactions for Protein: P22061

PCMT1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMT1P22061 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCMT1P22061 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PCMT1P22061 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCMT1P22061 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCMT1P22061 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCMT1P22061 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PCMT1P22061 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PCMT1P22061 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCMT1P22061 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCMT1P22061 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCMT1P22061 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCMT1P22061 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCMT1P22061 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCMT1P22061 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCMT1P22061 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCMT1P22061 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCMT1P22061 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCMT1P22061 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCMT1P22061 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCMT1P22061 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCMT1P22061 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCMT1P22061 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCMT1P22061 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCMT1P22061 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCMT1P22061 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCMT1P22061 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCMT1P22061 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCMT1P22061 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCMT1P22061 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCMT1P22061 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCMT1P22061 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCMT1P22061 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCMT1P22061 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCMT1P22061 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCMT1P22061 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCMT1P22061 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCMT1P22061 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCMT1P22061 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCMT1P22061 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCMT1P22061 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCMT1P22061 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCMT1P22061 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCMT1P22061 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCMT1P22061 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCMT1P22061 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCMT1P22061 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCMT1P22061 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCMT1P22061 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCMT1P22061 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCMT1P22061 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCMT1P22061 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCMT1P22061 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCMT1P22061 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCMT1P22061 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCMT1P22061 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCMT1P22061 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCMT1P22061 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCMT1P22061 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCMT1P22061 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCMT1P22061 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCMT1P22061 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCMT1P22061 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCMT1P22061 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCMT1P22061 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCMT1P22061 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PCMT1P22061 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCMT1P22061 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCMT1P22061 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PCMT1P22061 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCMT1P22061 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCMT1P22061 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCMT1P22061 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCMT1P22061 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCMT1P22061 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCMT1P22061 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PCMT1P22061 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PCMT1P22061 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PCMT1P22061 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PCMT1P22061 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PCMT1P22061 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PCMT1P22061 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PCMT1P22061 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PCMT1P22061 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PCMT1P22061 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PCMT1P22061 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCMT1P22061 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCMT1P22061 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PCMT1P22061 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCMT1P22061 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PCMT1P22061 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCMT1P22061 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PCMT1P22061 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCMT1P22061 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCMT1P22061 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PCMT1P22061 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCMT1P22061 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCMT1P22061 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PCMT1P22061 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PCMT1P22061 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PCMT1P22061 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms