Protein–RNA interactions for Protein: P20393

NR1D1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D1P20393 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NR1D1P20393 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NR1D1P20393 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NR1D1P20393 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR1D1P20393 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR1D1P20393 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR1D1P20393 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR1D1P20393 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NR1D1P20393 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NR1D1P20393 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NR1D1P20393 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NR1D1P20393 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NR1D1P20393 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NR1D1P20393 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NR1D1P20393 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NR1D1P20393 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NR1D1P20393 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NR1D1P20393 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NR1D1P20393 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NR1D1P20393 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NR1D1P20393 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NR1D1P20393 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NR1D1P20393 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NR1D1P20393 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NR1D1P20393 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NR1D1P20393 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NR1D1P20393 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NR1D1P20393 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NR1D1P20393 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NR1D1P20393 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NR1D1P20393 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NR1D1P20393 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NR1D1P20393 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NR1D1P20393 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NR1D1P20393 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NR1D1P20393 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NR1D1P20393 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NR1D1P20393 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NR1D1P20393 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NR1D1P20393 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NR1D1P20393 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NR1D1P20393 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NR1D1P20393 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NR1D1P20393 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NR1D1P20393 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NR1D1P20393 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NR1D1P20393 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NR1D1P20393 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NR1D1P20393 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NR1D1P20393 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NR1D1P20393 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NR1D1P20393 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NR1D1P20393 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NR1D1P20393 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NR1D1P20393 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NR1D1P20393 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NR1D1P20393 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NR1D1P20393 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NR1D1P20393 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NR1D1P20393 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NR1D1P20393 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NR1D1P20393 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NR1D1P20393 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NR1D1P20393 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NR1D1P20393 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NR1D1P20393 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NR1D1P20393 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NR1D1P20393 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
NR1D1P20393 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NR1D1P20393 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
NR1D1P20393 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NR1D1P20393 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NR1D1P20393 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NR1D1P20393 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NR1D1P20393 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NR1D1P20393 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NR1D1P20393 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NR1D1P20393 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NR1D1P20393 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NR1D1P20393 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NR1D1P20393 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NR1D1P20393 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NR1D1P20393 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NR1D1P20393 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NR1D1P20393 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NR1D1P20393 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NR1D1P20393 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NR1D1P20393 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NR1D1P20393 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NR1D1P20393 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NR1D1P20393 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NR1D1P20393 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NR1D1P20393 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NR1D1P20393 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NR1D1P20393 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NR1D1P20393 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NR1D1P20393 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NR1D1P20393 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NR1D1P20393 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NR1D1P20393 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms