Protein–RNA interactions for Protein: P20061

TCN1, Transcobalamin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCN1P20061 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCN1P20061 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCN1P20061 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCN1P20061 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCN1P20061 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCN1P20061 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCN1P20061 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCN1P20061 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCN1P20061 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCN1P20061 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCN1P20061 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCN1P20061 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCN1P20061 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCN1P20061 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCN1P20061 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCN1P20061 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCN1P20061 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCN1P20061 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCN1P20061 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCN1P20061 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCN1P20061 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCN1P20061 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCN1P20061 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCN1P20061 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCN1P20061 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCN1P20061 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCN1P20061 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCN1P20061 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCN1P20061 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCN1P20061 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCN1P20061 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCN1P20061 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCN1P20061 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCN1P20061 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCN1P20061 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCN1P20061 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TCN1P20061 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCN1P20061 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TCN1P20061 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TCN1P20061 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TCN1P20061 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TCN1P20061 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TCN1P20061 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TCN1P20061 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TCN1P20061 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TCN1P20061 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCN1P20061 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCN1P20061 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TCN1P20061 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCN1P20061 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCN1P20061 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCN1P20061 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCN1P20061 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCN1P20061 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCN1P20061 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCN1P20061 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCN1P20061 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCN1P20061 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TCN1P20061 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCN1P20061 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCN1P20061 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCN1P20061 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCN1P20061 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCN1P20061 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCN1P20061 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCN1P20061 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCN1P20061 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TCN1P20061 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TCN1P20061 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCN1P20061 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCN1P20061 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCN1P20061 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCN1P20061 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCN1P20061 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCN1P20061 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCN1P20061 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCN1P20061 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCN1P20061 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCN1P20061 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCN1P20061 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCN1P20061 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCN1P20061 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCN1P20061 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCN1P20061 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCN1P20061 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCN1P20061 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCN1P20061 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCN1P20061 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCN1P20061 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCN1P20061 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCN1P20061 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCN1P20061 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCN1P20061 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCN1P20061 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCN1P20061 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCN1P20061 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCN1P20061 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TCN1P20061 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCN1P20061 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCN1P20061 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms