Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CXCL2P19875 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CXCL2P19875 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms