Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERCC3P19447 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERCC3P19447 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERCC3P19447 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ERCC3P19447 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ERCC3P19447 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERCC3P19447 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERCC3P19447 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERCC3P19447 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ERCC3P19447 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERCC3P19447 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERCC3P19447 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERCC3P19447 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERCC3P19447 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERCC3P19447 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ERCC3P19447 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ERCC3P19447 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERCC3P19447 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERCC3P19447 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERCC3P19447 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERCC3P19447 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERCC3P19447 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERCC3P19447 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERCC3P19447 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERCC3P19447 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERCC3P19447 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ERCC3P19447 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERCC3P19447 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERCC3P19447 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERCC3P19447 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERCC3P19447 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ERCC3P19447 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ERCC3P19447 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ERCC3P19447 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ERCC3P19447 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERCC3P19447 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERCC3P19447 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERCC3P19447 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERCC3P19447 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERCC3P19447 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERCC3P19447 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERCC3P19447 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERCC3P19447 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ERCC3P19447 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERCC3P19447 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERCC3P19447 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERCC3P19447 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERCC3P19447 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ERCC3P19447 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERCC3P19447 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ERCC3P19447 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERCC3P19447 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERCC3P19447 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERCC3P19447 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERCC3P19447 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERCC3P19447 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERCC3P19447 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERCC3P19447 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERCC3P19447 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERCC3P19447 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERCC3P19447 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
ERCC3P19447 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERCC3P19447 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERCC3P19447 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERCC3P19447 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERCC3P19447 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERCC3P19447 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERCC3P19447 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ERCC3P19447 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERCC3P19447 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERCC3P19447 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERCC3P19447 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERCC3P19447 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERCC3P19447 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC3P19447 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC3P19447 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC3P19447 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC3P19447 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC3P19447 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC3P19447 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC3P19447 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC3P19447 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC3P19447 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERCC3P19447 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERCC3P19447 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERCC3P19447 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ERCC3P19447 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERCC3P19447 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERCC3P19447 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERCC3P19447 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERCC3P19447 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERCC3P19447 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERCC3P19447 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERCC3P19447 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERCC3P19447 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERCC3P19447 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERCC3P19447 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERCC3P19447 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERCC3P19447 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERCC3P19447 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms