Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDE6GP18545 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDE6GP18545 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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