Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VCLP18206 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VCLP18206 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VCLP18206 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VCLP18206 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VCLP18206 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VCLP18206 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VCLP18206 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VCLP18206 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VCLP18206 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VCLP18206 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VCLP18206 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VCLP18206 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VCLP18206 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VCLP18206 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VCLP18206 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VCLP18206 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VCLP18206 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VCLP18206 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VCLP18206 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VCLP18206 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VCLP18206 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VCLP18206 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VCLP18206 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VCLP18206 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VCLP18206 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VCLP18206 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VCLP18206 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VCLP18206 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VCLP18206 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VCLP18206 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VCLP18206 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VCLP18206 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VCLP18206 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VCLP18206 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VCLP18206 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VCLP18206 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VCLP18206 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VCLP18206 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VCLP18206 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VCLP18206 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VCLP18206 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VCLP18206 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VCLP18206 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCLP18206 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCLP18206 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCLP18206 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCLP18206 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VCLP18206 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VCLP18206 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
VCLP18206 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VCLP18206 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VCLP18206 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VCLP18206 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VCLP18206 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VCLP18206 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VCLP18206 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
VCLP18206 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VCLP18206 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VCLP18206 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VCLP18206 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VCLP18206 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VCLP18206 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VCLP18206 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VCLP18206 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCLP18206 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCLP18206 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCLP18206 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCLP18206 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCLP18206 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCLP18206 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCLP18206 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCLP18206 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCLP18206 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCLP18206 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VCLP18206 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VCLP18206 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VCLP18206 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VCLP18206 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VCLP18206 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VCLP18206 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VCLP18206 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VCLP18206 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VCLP18206 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VCLP18206 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VCLP18206 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VCLP18206 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VCLP18206 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VCLP18206 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
VCLP18206 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VCLP18206 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VCLP18206 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VCLP18206 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VCLP18206 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VCLP18206 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VCLP18206 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VCLP18206 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VCLP18206 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VCLP18206 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VCLP18206 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms