Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPI1P17947 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPI1P17947 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SPI1P17947 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPI1P17947 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPI1P17947 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPI1P17947 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPI1P17947 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPI1P17947 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPI1P17947 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPI1P17947 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPI1P17947 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPI1P17947 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SPI1P17947 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPI1P17947 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPI1P17947 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPI1P17947 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPI1P17947 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SPI1P17947 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPI1P17947 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPI1P17947 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPI1P17947 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SPI1P17947 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPI1P17947 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPI1P17947 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPI1P17947 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPI1P17947 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPI1P17947 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SPI1P17947 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SPI1P17947 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SPI1P17947 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SPI1P17947 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SPI1P17947 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SPI1P17947 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SPI1P17947 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SPI1P17947 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SPI1P17947 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPI1P17947 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPI1P17947 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPI1P17947 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPI1P17947 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SPI1P17947 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPI1P17947 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SPI1P17947 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPI1P17947 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPI1P17947 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SPI1P17947 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPI1P17947 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPI1P17947 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPI1P17947 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPI1P17947 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPI1P17947 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPI1P17947 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPI1P17947 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPI1P17947 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPI1P17947 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPI1P17947 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPI1P17947 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPI1P17947 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPI1P17947 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SPI1P17947 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPI1P17947 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPI1P17947 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPI1P17947 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPI1P17947 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPI1P17947 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPI1P17947 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPI1P17947 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPI1P17947 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPI1P17947 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPI1P17947 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPI1P17947 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPI1P17947 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPI1P17947 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPI1P17947 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPI1P17947 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPI1P17947 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPI1P17947 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPI1P17947 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPI1P17947 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPI1P17947 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPI1P17947 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPI1P17947 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPI1P17947 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPI1P17947 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPI1P17947 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPI1P17947 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPI1P17947 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPI1P17947 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPI1P17947 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPI1P17947 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPI1P17947 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPI1P17947 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPI1P17947 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SPI1P17947 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPI1P17947 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPI1P17947 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPI1P17947 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPI1P17947 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SPI1P17947 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms