Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTPS1P17812 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTPS1P17812 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CTPS1P17812 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTPS1P17812 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTPS1P17812 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTPS1P17812 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTPS1P17812 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTPS1P17812 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTPS1P17812 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTPS1P17812 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTPS1P17812 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTPS1P17812 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTPS1P17812 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTPS1P17812 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTPS1P17812 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTPS1P17812 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTPS1P17812 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTPS1P17812 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTPS1P17812 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTPS1P17812 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTPS1P17812 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTPS1P17812 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTPS1P17812 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTPS1P17812 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTPS1P17812 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CTPS1P17812 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTPS1P17812 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTPS1P17812 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CTPS1P17812 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTPS1P17812 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTPS1P17812 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTPS1P17812 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTPS1P17812 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTPS1P17812 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTPS1P17812 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CTPS1P17812 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTPS1P17812 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTPS1P17812 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CTPS1P17812 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CTPS1P17812 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTPS1P17812 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTPS1P17812 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CTPS1P17812 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTPS1P17812 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTPS1P17812 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CTPS1P17812 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTPS1P17812 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTPS1P17812 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTPS1P17812 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CTPS1P17812 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CTPS1P17812 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTPS1P17812 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTPS1P17812 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CTPS1P17812 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTPS1P17812 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTPS1P17812 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTPS1P17812 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTPS1P17812 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CTPS1P17812 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTPS1P17812 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTPS1P17812 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CTPS1P17812 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTPS1P17812 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTPS1P17812 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTPS1P17812 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTPS1P17812 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTPS1P17812 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CTPS1P17812 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTPS1P17812 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTPS1P17812 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CTPS1P17812 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTPS1P17812 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTPS1P17812 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CTPS1P17812 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTPS1P17812 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTPS1P17812 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTPS1P17812 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTPS1P17812 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTPS1P17812 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CTPS1P17812 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTPS1P17812 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTPS1P17812 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTPS1P17812 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CTPS1P17812 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTPS1P17812 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CTPS1P17812 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTPS1P17812 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTPS1P17812 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTPS1P17812 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTPS1P17812 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTPS1P17812 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CTPS1P17812 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTPS1P17812 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTPS1P17812 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTPS1P17812 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTPS1P17812 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTPS1P17812 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTPS1P17812 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CTPS1P17812 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms