Protein–RNA interactions for Protein: P17612

PRKACA, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACAP17612 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKACAP17612 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKACAP17612 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRKACAP17612 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKACAP17612 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKACAP17612 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKACAP17612 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKACAP17612 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKACAP17612 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKACAP17612 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKACAP17612 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKACAP17612 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKACAP17612 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKACAP17612 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKACAP17612 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKACAP17612 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKACAP17612 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRKACAP17612 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKACAP17612 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKACAP17612 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKACAP17612 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKACAP17612 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKACAP17612 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKACAP17612 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKACAP17612 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKACAP17612 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKACAP17612 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKACAP17612 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRKACAP17612 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKACAP17612 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKACAP17612 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKACAP17612 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKACAP17612 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKACAP17612 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKACAP17612 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKACAP17612 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKACAP17612 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKACAP17612 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKACAP17612 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRKACAP17612 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRKACAP17612 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PRKACAP17612 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms