Protein–RNA interactions for Protein: P16871

IL7R, Interleukin-7 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL7RP16871 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IL7RP16871 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IL7RP16871 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IL7RP16871 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IL7RP16871 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IL7RP16871 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IL7RP16871 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IL7RP16871 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IL7RP16871 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IL7RP16871 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IL7RP16871 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IL7RP16871 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IL7RP16871 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IL7RP16871 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IL7RP16871 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IL7RP16871 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IL7RP16871 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
IL7RP16871 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IL7RP16871 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IL7RP16871 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IL7RP16871 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IL7RP16871 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IL7RP16871 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IL7RP16871 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IL7RP16871 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IL7RP16871 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IL7RP16871 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
IL7RP16871 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IL7RP16871 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IL7RP16871 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
IL7RP16871 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IL7RP16871 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IL7RP16871 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IL7RP16871 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IL7RP16871 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IL7RP16871 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IL7RP16871 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IL7RP16871 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
IL7RP16871 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IL7RP16871 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IL7RP16871 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IL7RP16871 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IL7RP16871 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IL7RP16871 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IL7RP16871 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IL7RP16871 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IL7RP16871 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IL7RP16871 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IL7RP16871 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IL7RP16871 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IL7RP16871 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IL7RP16871 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IL7RP16871 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IL7RP16871 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IL7RP16871 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IL7RP16871 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IL7RP16871 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IL7RP16871 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IL7RP16871 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IL7RP16871 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IL7RP16871 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IL7RP16871 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IL7RP16871 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IL7RP16871 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IL7RP16871 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IL7RP16871 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IL7RP16871 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IL7RP16871 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IL7RP16871 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IL7RP16871 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IL7RP16871 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IL7RP16871 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IL7RP16871 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IL7RP16871 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IL7RP16871 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
IL7RP16871 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IL7RP16871 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IL7RP16871 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IL7RP16871 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IL7RP16871 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IL7RP16871 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IL7RP16871 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
IL7RP16871 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IL7RP16871 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IL7RP16871 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IL7RP16871 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IL7RP16871 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IL7RP16871 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
IL7RP16871 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IL7RP16871 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
IL7RP16871 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
IL7RP16871 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
IL7RP16871 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IL7RP16871 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IL7RP16871 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IL7RP16871 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IL7RP16871 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
IL7RP16871 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IL7RP16871 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IL7RP16871 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms