Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CD44P16070 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CD44P16070 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CD44P16070 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CD44P16070 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CD44P16070 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CD44P16070 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CD44P16070 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CD44P16070 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CD44P16070 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CD44P16070 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CD44P16070 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CD44P16070 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CD44P16070 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CD44P16070 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CD44P16070 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CD44P16070 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CD44P16070 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CD44P16070 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CD44P16070 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CD44P16070 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CD44P16070 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CD44P16070 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CD44P16070 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CD44P16070 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CD44P16070 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CD44P16070 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CD44P16070 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CD44P16070 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CD44P16070 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CD44P16070 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CD44P16070 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CD44P16070 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CD44P16070 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CD44P16070 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CD44P16070 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CD44P16070 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CD44P16070 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CD44P16070 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CD44P16070 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CD44P16070 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CD44P16070 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CD44P16070 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CD44P16070 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CD44P16070 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CD44P16070 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CD44P16070 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CD44P16070 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CD44P16070 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CD44P16070 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CD44P16070 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CD44P16070 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CD44P16070 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CD44P16070 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CD44P16070 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CD44P16070 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CD44P16070 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CD44P16070 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CD44P16070 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CD44P16070 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CD44P16070 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CD44P16070 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CD44P16070 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CD44P16070 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CD44P16070 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CD44P16070 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CD44P16070 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CD44P16070 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CD44P16070 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CD44P16070 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CD44P16070 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CD44P16070 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CD44P16070 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CD44P16070 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CD44P16070 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CD44P16070 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD44P16070 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD44P16070 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD44P16070 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD44P16070 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD44P16070 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD44P16070 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD44P16070 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD44P16070 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CD44P16070 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD44P16070 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD44P16070 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD44P16070 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD44P16070 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD44P16070 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD44P16070 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CD44P16070 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CD44P16070 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CD44P16070 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CD44P16070 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD44P16070 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD44P16070 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD44P16070 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CD44P16070 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CD44P16070 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms