Protein–RNA interactions for Protein: P15923

TCF3, Transcription factor E2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF3P15923 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCF3P15923 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCF3P15923 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCF3P15923 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCF3P15923 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TCF3P15923 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCF3P15923 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TCF3P15923 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCF3P15923 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TCF3P15923 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCF3P15923 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCF3P15923 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCF3P15923 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TCF3P15923 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCF3P15923 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCF3P15923 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCF3P15923 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCF3P15923 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCF3P15923 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TCF3P15923 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TCF3P15923 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCF3P15923 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCF3P15923 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TCF3P15923 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCF3P15923 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCF3P15923 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCF3P15923 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCF3P15923 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TCF3P15923 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF3P15923 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF3P15923 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF3P15923 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF3P15923 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF3P15923 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TCF3P15923 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCF3P15923 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TCF3P15923 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCF3P15923 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCF3P15923 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCF3P15923 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCF3P15923 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCF3P15923 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCF3P15923 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TCF3P15923 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
TCF3P15923 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCF3P15923 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCF3P15923 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCF3P15923 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCF3P15923 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCF3P15923 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TCF3P15923 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TCF3P15923 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TCF3P15923 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TCF3P15923 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCF3P15923 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCF3P15923 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCF3P15923 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TCF3P15923 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCF3P15923 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCF3P15923 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCF3P15923 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TCF3P15923 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TCF3P15923 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TCF3P15923 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCF3P15923 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCF3P15923 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCF3P15923 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCF3P15923 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCF3P15923 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCF3P15923 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCF3P15923 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCF3P15923 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TCF3P15923 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCF3P15923 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCF3P15923 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCF3P15923 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCF3P15923 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCF3P15923 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCF3P15923 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCF3P15923 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCF3P15923 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TCF3P15923 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCF3P15923 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCF3P15923 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCF3P15923 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCF3P15923 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCF3P15923 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TCF3P15923 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TCF3P15923 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCF3P15923 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TCF3P15923 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCF3P15923 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCF3P15923 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TCF3P15923 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCF3P15923 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCF3P15923 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCF3P15923 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCF3P15923 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCF3P15923 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TCF3P15923 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms