Protein–RNA interactions for Protein: P15172

MYOD1, Myoblast determination protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOD1P15172 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MYOD1P15172 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MYOD1P15172 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms