Protein–RNA interactions for Protein: P15088

CPA3, Mast cell carboxypeptidase A, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA3P15088 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPA3P15088 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPA3P15088 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPA3P15088 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPA3P15088 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPA3P15088 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPA3P15088 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPA3P15088 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPA3P15088 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPA3P15088 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPA3P15088 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPA3P15088 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPA3P15088 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPA3P15088 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPA3P15088 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPA3P15088 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPA3P15088 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPA3P15088 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPA3P15088 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPA3P15088 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPA3P15088 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPA3P15088 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPA3P15088 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPA3P15088 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPA3P15088 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPA3P15088 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPA3P15088 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CPA3P15088 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CPA3P15088 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CPA3P15088 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CPA3P15088 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CPA3P15088 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CPA3P15088 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CPA3P15088 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CPA3P15088 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPA3P15088 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPA3P15088 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPA3P15088 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPA3P15088 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPA3P15088 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPA3P15088 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPA3P15088 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPA3P15088 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPA3P15088 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPA3P15088 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPA3P15088 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPA3P15088 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPA3P15088 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPA3P15088 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPA3P15088 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPA3P15088 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPA3P15088 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPA3P15088 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPA3P15088 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPA3P15088 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPA3P15088 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPA3P15088 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPA3P15088 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPA3P15088 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPA3P15088 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPA3P15088 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPA3P15088 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPA3P15088 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPA3P15088 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CPA3P15088 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPA3P15088 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPA3P15088 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CPA3P15088 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPA3P15088 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPA3P15088 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPA3P15088 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPA3P15088 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPA3P15088 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPA3P15088 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPA3P15088 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPA3P15088 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPA3P15088 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CPA3P15088 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPA3P15088 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPA3P15088 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPA3P15088 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CPA3P15088 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CPA3P15088 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CPA3P15088 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPA3P15088 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CPA3P15088 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPA3P15088 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPA3P15088 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPA3P15088 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPA3P15088 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPA3P15088 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPA3P15088 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPA3P15088 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPA3P15088 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPA3P15088 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPA3P15088 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPA3P15088 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPA3P15088 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPA3P15088 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPA3P15088 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms