Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC130P13994 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC130P13994 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC130P13994 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC130P13994 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC130P13994 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC130P13994 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC130P13994 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC130P13994 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC130P13994 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC130P13994 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC130P13994 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC130P13994 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC130P13994 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC130P13994 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC130P13994 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC130P13994 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC130P13994 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC130P13994 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC130P13994 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC130P13994 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC130P13994 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC130P13994 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC130P13994 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC130P13994 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC130P13994 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC130P13994 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC130P13994 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC130P13994 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC130P13994 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC130P13994 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC130P13994 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC130P13994 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC130P13994 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC130P13994 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC130P13994 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC130P13994 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC130P13994 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC130P13994 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC130P13994 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC130P13994 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC130P13994 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC130P13994 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC130P13994 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC130P13994 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC130P13994 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC130P13994 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC130P13994 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC130P13994 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC130P13994 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC130P13994 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC130P13994 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC130P13994 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC130P13994 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC130P13994 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC130P13994 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC130P13994 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC130P13994 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC130P13994 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC130P13994 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC130P13994 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC130P13994 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC130P13994 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC130P13994 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC130P13994 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC130P13994 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC130P13994 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC130P13994 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC130P13994 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC130P13994 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC130P13994 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC130P13994 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC130P13994 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC130P13994 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC130P13994 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC130P13994 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC130P13994 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC130P13994 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC130P13994 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC130P13994 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC130P13994 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC130P13994 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC130P13994 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC130P13994 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC130P13994 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC130P13994 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC130P13994 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC130P13994 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC130P13994 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC130P13994 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC130P13994 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC130P13994 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC130P13994 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC130P13994 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC130P13994 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC130P13994 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC130P13994 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC130P13994 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC130P13994 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC130P13994 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms