Protein–RNA interactions for Protein: P12081

HARS, Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARSP12081 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HARSP12081 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HARSP12081 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HARSP12081 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HARSP12081 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HARSP12081 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HARSP12081 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HARSP12081 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HARSP12081 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HARSP12081 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HARSP12081 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HARSP12081 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HARSP12081 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HARSP12081 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HARSP12081 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HARSP12081 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HARSP12081 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HARSP12081 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HARSP12081 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HARSP12081 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HARSP12081 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HARSP12081 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HARSP12081 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HARSP12081 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HARSP12081 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HARSP12081 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HARSP12081 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HARSP12081 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HARSP12081 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HARSP12081 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HARSP12081 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HARSP12081 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HARSP12081 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HARSP12081 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HARSP12081 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HARSP12081 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HARSP12081 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HARSP12081 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HARSP12081 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HARSP12081 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HARSP12081 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HARSP12081 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HARSP12081 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HARSP12081 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HARSP12081 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HARSP12081 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HARSP12081 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HARSP12081 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HARSP12081 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HARSP12081 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HARSP12081 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HARSP12081 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HARSP12081 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HARSP12081 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HARSP12081 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HARSP12081 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HARSP12081 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HARSP12081 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HARSP12081 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HARSP12081 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HARSP12081 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HARSP12081 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HARSP12081 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HARSP12081 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HARSP12081 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HARSP12081 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HARSP12081 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HARSP12081 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HARSP12081 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HARSP12081 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HARSP12081 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HARSP12081 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HARSP12081 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HARSP12081 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HARSP12081 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HARSP12081 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HARSP12081 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HARSP12081 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
HARSP12081 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
HARSP12081 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
HARSP12081 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
HARSP12081 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
HARSP12081 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HARSP12081 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HARSP12081 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HARSP12081 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HARSP12081 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HARSP12081 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HARSP12081 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HARSP12081 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HARSP12081 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HARSP12081 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HARSP12081 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HARSP12081 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HARSP12081 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HARSP12081 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HARSP12081 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HARSP12081 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HARSP12081 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HARSP12081 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms